Konak-Bakteri İlişkileri, Bakteriyel Patogenez, Flora/Mikrobiyota

Bu video dersi, bakterilerin üreme ve hayatta kalma stratejilerini belirleyen genetik, metabolik ve biyoteknolojik süreçleri incelemektedir. İçerik çerçevesinde, replikasyon çatısındaki enzimler, kesintili zincir sentezindeki Okazaki segmentleri ve bu boşlukları dolduran DNA ligaz enzimi ele alınmaktadır. Hücre içi paketlenmeyi yöneten DNA giraz enzim sisteminin önemi ve transkripsiyonel kontroldeki operon yapıları tartışılmaktadır. Hızlı bölünmeye bağlı gelişen doğal mutasyon dinamikleri, antibiyotiklerin bu mutantları seçme şekli olan seleksiyon baskısı ve direnç genlerinin yayılmasında rol alan sıçrayan gen elemanları, yani transpozonlar işlenmektedir. Yatay gen transfer yollarından, serbest DNA'nın hücre içine alındığı transformasyon (Griffith deneyi), bakteriyofajların rol aldığı transdüksiyon ve doğrudan seks pilusu bağlantısıyla plazmit kopyalanmasını sağlayan konjugasyon süreçleri ele alınmaktadır. Bakterilerin üreme fizyolojisi dâhilinde demir yakalayan siderofor yapıları, besi yerlerindeki karbon girdileri, kanlı agardaki farklı eritrosit reaksiyonlarını temsil eden hemoliz tipleri ve buzdolabında çoğalabilen soğuksever psikrofil bakterilerden Listeria ve Yersinia sınıflandırılmaktadır. Laboratuvarda kullanılan, bakteriyel ribozomal protein analizine dayalı hızlı MALDI-TOF kütle spektrometrisi, moleküler düzeyde duyarlı real-time PCR ve bakteriyel savunma mekanizmasından türetilen Nobel ödüllü CRISPR-Cas9 teknoloji ele alınmaktadır.